百度云加速使用的漏洞扫描器是企业级别扫描器，对站点安全要求更加严格，所以会导致一些站长认为不是漏洞的安全问题(例如服务器或者PHP版本低)也被百度标记为危险网站。此外，百度还称，如果站长认为网站存在被误标情况，可到百度网址安全中心进行申诉(误报网站是站长认为没有木马病毒的网站。)。再者，站长也可在安全中心举报可疑网站(如可能存在木马病毒、欺诈钓鱼等行为的站点)。