主机设置错误一般出现在维护技术单薄的独立服务器中、一些没有经验的小型虚拟主机供应商身上。对搜索引擎蜘蛛来说，虽然它尽量模拟普通用户的行为对网站进行访问，但是毕竟不是真的网民，所以很多时候网站对用户来说是可以正常访问的，但是因为服务器设置错误，对搜索引擎蜘蛛来说却是不可以访问的。
有些没有独立主机维护经验的搜索引擎优化者，往往会根据网络上不知所谓的某些文章，对服务器进行千奇百怪的设置，比如重新定义服务器返回代码，将普通网民能正常打开的页面返回信息改成4(}4等。这样的设置错误对用户来说无所谓，对搜索引擎优化来说就是灾难。
有时候，主机设置错误很细微、很难发现，所以为避免出现这种情况，独立主机应该尽量选择有经验的维护者，虚拟主机购买者应该购买品牌信誉比较好的空间并在购买前进行仔细测试。主机空间是有地理属性的，很多国际性的搜索引擎考虑到用户体验，会根据搜索者的不同地域返回不同地域的网站信息.这时候主机空间的地理属性就会对SBo产生影响。在国内，百度会根据不同地域的访问者，返回与之地域相对应的网站信息。举例来说.如果搜索引擎优化者做一个英文的网站，并将主机放置在英国本土，那么此网站在Google.com.uk中的关键词排名就要比在Google.com中的排名好一些:同样，如果英国的用户在Google.com中进行搜索，主机在英国本土的网站排名也会略好一些。对中文网站来说，地理位置同样也很重要，比如在百度中搜索某些关键词，搜索结果往往会返回搜索用户所在地的网站或者信息。比如在深圳上网的用户，在百度中搜索“租车”，在返回的结果中，会自然地将“深圳租车”的排名提前。